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  3. R での limma を用いた Differential Expression 解析
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Bài tập

3群での差次的発現を検定する

デザイン行列とコントラスト行列を指定できたので、差次的発現を検定していきます。

Hướng dẫn

100 XP

低酸素データを含む ExpressionSet オブジェクト eset、デザイン行列（design）、コントラスト行列（cm）はワークスペースに読み込まれています。

  • lmFit でモデル係数を当てはめます。

  • contrasts.fit でコントラストを当てはめます。

  • eBayes で t 統計量を計算します。

  • decideTests で結果を要約します。