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演習

ExpressionSet オブジェクトを作成する

1 つの実験で 3 種類のデータセットを個別に管理するのは手間がかかり、フィルタリングを行う場合は特にミスの原因になります。Bioconductor の ExpressionSet クラスを使って、白血病実験の 3 つのデータセットを 1 つのオブジェクトに統合しましょう。

指示

100 XP

発現行列(x)、フィーチャデータ(f)、フェノタイプデータ(p)はワークスペースに読み込まれています。

  • ExpressionSet 関数を使って新しい ExpressionSet オブジェクトを作成します。

  • 発現行列を assayData 引数に渡します。

  • フェノタイプのデータフレームを phenoData 引数に渡します。

  • フィーチャのデータフレームを featureData 引数に渡します。