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  3. R での limma を用いた Differential Expression 解析
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演習

デザイン行列

ドキソルビシンの実験は 2×2 の要因計画なので、グループ平均のパラメータ化で使うために結合した変数を作成する必要があります。

指示

100 XP

ドキソルビシンのデータを含む ExpressionSet オブジェクト eset は、ワークスペースに読み込まれています。

  • genotype（WT と Top2b null）と treatment（PBS と Dox）を結合して、単一の因子変数を作成します。

  • model.matrix を使って、切片なしのデザイン行列を作成します。