1. Учиться
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. ChIP-seq với Bioconductor trong R
Connected

Exercise

Khớp mô hình

Giờ bạn đã sẵn sàng thực hiện phân tích liên kết khác biệt. Phân tích này sẽ cho biết đỉnh (peak) nào khác biệt có ý nghĩa về cường độ giữa hai loại khối u. Việc biết những đỉnh khác nhau giữa các nhóm sẽ là nền tảng cho các phân tích tiếp theo nhằm xác định cơ chế nền tảng dẫn đến các khác biệt này. Trước mắt, hãy tìm các đỉnh được liên kết khác biệt. Hàm dba.analyze() từ gói DiffBind cho phép bạn làm điều đó. Ở bài trước, bạn đã thiết lập tương phản để so sánh giữa các loại khối u. Dùng đối tượng đã có tương phản, bạn chỉ cần gọi dba.analyze() để thực hiện phần còn lại.

Инструкции

100 XP
  • Kiểm tra đối tượng ar_binding để xác nhận rằng nó chứa tương phản cần thiết.
  • Chạy phân tích liên kết khác biệt.
  • Kiểm tra kết quả.