Theo bạn, các mẫu này có giống nhau không?
Xem xét các biểu đồ PCA giúp bạn hình dung mức độ tương đồng và khác biệt giữa các mẫu ở quy mô tổng thể. Từ đầu ra tạo ra trong bước QC mẫu, bạn có thể dễ dàng vẽ biểu đồ PCA của dữ liệu đã xử lý. Dưới đây là biểu đồ cho cả bốn mẫu đã vượt qua QC.

Quan sát biểu đồ rồi cân nhắc các phát biểu sau. Những phát biểu nào là đúng?
- Các mẫu được gom cụm theo điều kiện.
- Có thể tạo một biểu đồ như thế này bằng hàm
plotPrincomp(). - Dùng biểu đồ PCA, bạn có thể dễ dàng thấy những đỉnh (peak) khác biệt nhiều nhất giữa các nhóm.
Bài tập này là một phần của khóa học
ChIP-seq với Bioconductor trong R
Bài tập tương tác thực hành
Biến lý thuyết thành hành động với một trong các bài tập tương tác của chúng tôi
Bắt đầu bài tập