1. Học hỏi
    2. /
  2. Khoa Học
    3. /
  3. ChIP-seq với Bioconductor trong R
Connected

Bài tập

Đọc tệp BED

Trong bài tập này, bạn sẽ nạp các peak call từ một tệp BED và dùng thông tin về vị trí peak để trích xuất các read chồng lắp với các peak từ một tệp BAM.

Hướng dẫn

100 XP
  • Dùng hàm import.bed để nạp các peak call từ chr20_peaks.
  • Dùng các peak call này để tạo một đối tượng BamViews cho chr20_bam.
  • Nạp các read chồng lắp với các peak call.