Kutu grafiği oluştur

Lösemi veri kümesini, ilk genin ifade düzeylerini stabil ve progresif lösemili hastalar için kutu grafikleriyle görselleştirerek keşfet.

Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır

R ile limma kullanarak Diferansiyel Ekspresyon Analizi

İfade matrisi (x), özellik verileri (f) ve fenotip verileri (p) çalışma alanına yüklendi.

x'i yalnızca ilk geni (yani satırı) içerecek şekilde alt kümeye ayır ve formülde ~ işaretinin soluna (y ekseni) yerleştir.
p'yi yalnızca "Disease" sütununu içerecek şekilde alt kümeye ayır ve formülde ~ işaretinin sağına (x ekseni) yerleştir.
f'yi yalnızca ilk geni (yani satırı) ve "symbol" sütununu içerecek şekilde alt kümeye ayır. Bunu grafik başlığı için main bağımsız değişkeni olarak kullan.

Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)