Top2b'nin Kutu Grafiği

Şimdi bir sağlamlık kontrolü: Null farelerde Top2b ekspresyon düzeylerinin daha düşük olduğunu doğrulamak için Top2b'nin ekspresyon düzeyinin bir kutu grafiğini oluştur.

Bölüm 1, Egzersiz 4'te benzer bir kutu grafiği yaptığını hatırla.

Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır

R ile limma kullanarak Diferansiyel Ekspresyon Analizi

Kursa Göz Atın

Egzersiz talimatları

Doksorubisin verisine ait ExpressionSet nesnesi eset çalışma alanına yüklendi.

Özellik verisi sütunu "symbol" içinde "Top2b" araması yaparak Top2b verisini içeren satırı bul.
Formül sözdizimini kullanarak bir kutu grafiği oluştur. ~ işaretinin solunda ekspresyon düzeyi, sağında ise genotip değişkeni olmalı.
Grafiğe başlık vermek için özellik veri çerçevesindeki bu satırı main argümanına geçir.

Uygulamalı etkileşimli egzersiz

Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.

# Find the row which contains Top2b expression data
top2b <- which(___(eset)[___] == "Top2b")

# Plot Top2b expression versus genotype
boxplot(___(eset)[top2b, ] ~ ___(eset)[___],
        main = ___(eset)[top2b, ])

Kodu Düzenle ve Çalıştır