เริ่มต้นใช้งานเริ่มต้นใช้งานได้ฟรี

การโหลดจำนวน Read

ดังที่เห็นในวิดีโอ ต้องสร้างชุด consensus peak calls ก่อนจึงจะทดสอบ differential binding ได้ ซึ่งทำได้ด้วยโค้ด R ต่อไปนี้:

ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)

พิจารณาข้อความต่อไปนี้

  1. ใน ar_counts ทุก sample จะมี read counts สำหรับ peak calls ชุดเดียวกัน
  2. read counts บางส่วนอาจเป็น 0
  3. ทุก peak ใน ar_counts มีความกว้าง 200 bp
  4. ทุก peak ใน ar_counts มีความกว้าง 400 bp

ข้อใดถูกต้อง?

แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร

ChIP-seq with Bioconductor in R

ดูคอร์ส

แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำจริง

เปลี่ยนทฤษฎีให้เป็นการลงมือทำด้วยแบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบหนึ่งในของเรา

เริ่มแบบฝึกหัด