เปรียบเทียบข้อมูลที่กรองแล้วกับ read ดิบ
มาดูความแตกต่างที่เกิดจากการกรอง read ให้ละเอียดขึ้น นี่คือกราฟที่แสดง track ความครอบคลุม 3 แบบ จากบนลงล่างแสดงความครอบคลุมทั้งหมด ความครอบคลุมจาก alignment คุณภาพสูง และความครอบคลุมจาก alignment คุณภาพต่ำ
พิจารณากราฟด้านบน ข้อความใดต่อไปนี้อธิบายข้อมูล coverage ที่แสดงได้อย่างถูกต้อง?
- alignment ของ read ส่วนใหญ่มีคุณภาพสูง
- peak ที่โดดเด่นที่สุดมาจาก alignment คุณภาพต่ำ
- มี peak ในโปรไฟล์ coverage คุณภาพสูง
แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร
ChIP-seq with Bioconductor in R
แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำจริง
เปลี่ยนทฤษฎีให้เป็นการลงมือทำด้วยแบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบหนึ่งในของเรา
เริ่มแบบฝึกหัด