Boxplot pentru Top2b

Urmează o verificare de control: creează un boxplot al nivelului de expresie al Top2b pentru a confirma că șoarecii null au niveluri mai scăzute de expresie a Top2b.

Amintește-ți că ai realizat un boxplot similar în Capitolul 1, Exercițiul 4.

Acest exercițiu face parte din cursul

Analiza expresiei diferențiale cu limma în R

Vezi cursul

Instrucțiuni pentru exercițiu

Obiectul ExpressionSet eset cu datele despre doxorubicină a fost încărcat în spațiul tău de lucru.

Găsește rândul care conține datele Top2b căutând coloana "symbol" din cadrul de date cu caracteristici după valoarea "Top2b".
Creează un boxplot folosind sintaxa cu formulă. Nivelul de expresie trebuie să fie în stânga lui ~, iar variabila de genotip în dreapta.
Transmite rândul din cadrul de date cu caracteristici către main pentru a titla graficul.

Exercițiu interactiv practic

Încearcă acest exercițiu completând acest cod de exemplu.

# Find the row which contains Top2b expression data
top2b <- which(___(eset)[___] == "Top2b")

# Plot Top2b expression versus genotype
boxplot(___(eset)[top2b, ] ~ ___(eset)[___],
        main = ___(eset)[top2b, ])

Editează și rulează codul