Które piki są różne?

Przyjrzyjmy się, jak bardzo próbki różnią się pod względem wywołanych pików. Patrząc na scalone piki, z którymi pracowałeś wcześniej – ile pików jest wspólnych dla różnych próbek?

Jednym z wykresów, który odpowie na to pytanie, jest diagram Venna. Można go utworzyć bezpośrednio z obiektu DBA za pomocą funkcji dba.plotVenn(). Alternatywą jest wykres UpSet, który możesz stworzyć za pomocą pakietu UpSetR. Zastępuje on elipsy diagramu Venna szeregiem wykresów słupkowych pokazujących rozmiary różnych podzbiorów. Funkcja upset() wymaga podania ramki danych z jedną kolumną dla każdego zestawu (czyli próbki), wskazującą przynależność każdego piku do zestawu. Potrzebne dane znajdują się w polu called obiektu ar_diff.

Utwórz diagram Venna na podstawie obiektu ar_diff.

ćwiczenie

Które piki są różne?

Instrukcje 1/2

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}ćwiczenie

Instrukcje 1/2

ćwiczenie