Czy te próbki wyglądają tak samo?
Analiza wykresów PCA pozwala ocenić podobieństwa i różnice między próbkami w skali globalnej. Korzystając z wyników wygenerowanych podczas kontroli jakości próbek, można w prosty sposób tworzyć wykresy PCA dla przetworzonych danych. Poniżej znajduje się wykres dla wszystkich czterech próbek, które przeszły kontrolę jakości.

Przeanalizuj wykres, a następnie oceń poniższe stwierdzenia. Które z nich są prawdziwe?
- Próbki grupują się według warunków.
- Taki wykres można utworzyć za pomocą funkcji
plotPrincomp(). - Na podstawie wykresu PCA łatwo zobaczyć, które piki różnią się najbardziej między grupami.
To ćwiczenie jest częścią kursu
ChIP-seq z Bioconductor w R
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Przekształć teorię w praktykę dzięki jednemu z naszych interaktywnych ćwiczeń
Rozpocznij ćwiczenie