1. Learn
  2. /
  3. Kurser
  4. /
  5. ChIP-seq z Bioconductor w R

Connected

övning

Wczytywanie plików BED

W tym ćwiczeniu wczytasz wywołania pików z pliku BED, a następnie wykorzystasz informacje o lokalizacji pików do wyodrębnienia odczytów pokrywających się z pikami z pliku BAM.

Instruktioner

100 XP
  • Użyj funkcji import.bed, aby wczytać wywołania pików z pliku chr20_peaks.
  • Na podstawie tych wywołań pików utwórz obiekt BamViews dla pliku chr20_bam.
  • Wczytaj odczyty pokrywające się z wywołaniami pików.