Podsumowanie różnic w wiązaniu białek

Ostatnim wykresem różnicowo związanych szczytów, który poznasz w tej lekcji, jest wykres pudełkowy. Ten typ wykresu pozwala podsumować rozkład intensywności szczytów w każdej próbce. DiffBind udostępnia do tego celu funkcję dba.plotBox(). Wykresy pudełkowe pokazują położenie mediany w poszczególnych grupach oraz rozrzut danych wokół niej. Wykres generowany przez DiffBind porównuje dwie grupy (guz pierwotny i guz oporny na leczenie) oraz podgrupy złożone z różnicowo związanych szczytów. Oprócz samego wykresu dba.plotBox() zwraca również wartości p dla porównań parami między tymi grupami.

Podobnie jak wcześniej, wyniki analizy różnicowego wiązania są dostępne jako ar_diff.

Utwórz wykres pudełkowy intensywności szczytów.
Sprawdź zwrócone wartości p. Które zestawy szczytów różnią się od siebie w sposób istotny statystycznie?

ćwiczenie

Podsumowanie różnic w wiązaniu białek

Instrukcje

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}ćwiczenie

Instrukcje

ćwiczenie