ćwiczenie

Filtrowanie odczytów

W tym ćwiczeniu wyczyścisz dane, usuwając odczyty o niskiej jakości wyrównań. Aby to zrobić, musisz wczytać informacje o jakości wyrównań z pliku BAM. Są one przechowywane w polu mapq.

Instrukcje

100 XP

Wczytaj reads wraz z informacjami o jakości wyrównań przypisanych do każdego odczytu.
Zidentyfikuj wszystkie wyrównania o jakości co najmniej 20.
Utwórz wykres pudełkowy porównujący rozkłady jakości wyrównań między grupą wysokiej i niskiej jakości.
Usuń wszystkie wyrównania o niskiej jakości.

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}ćwiczenie

Instrukcje

ćwiczenie