Dopasowanie modelu

Teraz możesz przeprowadzić analizę różnicowego wiązania. Pozwoli ona określić, które spośród pików różnią się istotnie pod względem intensywności między dwoma typami nowotworów. Wiedza o tym, które piki różnią się między grupami, stanowi punkt wyjścia do dalszych analiz mających na celu odkrycie mechanizmów leżących u podstaw tych różnic. Na razie skupmy się na znalezieniu pików wykazujących różnicowe wiązanie. Służy do tego funkcja dba.analyze() z pakietu DiffBind. W poprzednim ćwiczeniu ustaliłeś kontrast dla porównania między typami nowotworów. Korzystając z obiektu zawierającego ten kontrast, wystarczy wywołać dba.analyze(), aby wykonać pozostałe kroki.

Sprawdź obiekt ar_binding, aby potwierdzić, że zawiera wymagany kontrast.
Uruchom analizę różnicowego wiązania.
Sprawdź wynik.

道练习

Dopasowanie modelu

说明

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}道练习

说明

道练习