1. Nauka
  2. /
  3. Kursy
  4. /
  5. ChIP-seq z Bioconductor w R

Connected

ćwiczenie

Piki a tło

Czas porównać rozkład pokrycia dla pików, regionów z czarnej listy i tła. W tym ćwiczeniu przeanalizujesz dane z chromosomu 5. Zliczenia odczytów w przedziałach dla pików, regionów z czarnej listy i tła są dostępne odpowiednio jako peak_bins, bl_bins i bkg_bins. Kolumna score zawiera zliczenia odczytów.

Wczytanie wszystkich wymaganych danych i pakietów R może chwilę potrwać. Prosimy o cierpliwość.

Instrukcje

100 XP
  • Przygotuj zliczenia odczytów do wizualizacji, organizując je w ramkach danych.
  • Połącz trzy ramki danych za pomocą rbind().
  • Stwórz wykres pudełkowy zliczeń odczytów według typu przedziału.