1. Nauka
  2. /
  3. Kursy
  4. /
  5. ChIP-seq z Bioconductor w R

Connected

ćwiczenie

Wykres wulkaniczny

Wykresy wulkaniczne przedstawiają zależność między różnicą między grupami (wyrażoną jako logarytmiczna krotność zmiany) a wartościami p testu porównującego intensywności szczytów. Daje to wizualny przegląd wyników istotnych statystycznie oraz ich wielkości efektu. DiffBind udostępnia funkcję dba.plotVolcano() do tworzenia takich wykresów.

Obiekt ar_diff zawiera wyniki analizy różnicowego wiązania.

Instrukcje

100 XP
  • Utwórz wykres wulkaniczny.
  • Przeanalizuj wykres. Gdzie znajdują się istotne statystycznie wyniki?