Dodawanie adnotacji
Przyjrzyj się temu wykresowi:

Jest bardzo podobny do tego, który utworzyłeś w poprzednim ćwiczeniu. Oprócz danych widoczna jest na nim ścieżka o nazwie Genes z adnotacjami genów. W jakiej kolejności należy wykonać poniższe fragmenty kodu, aby dodać tę ścieżkę do wykresu?
Fragment 1
plotTracks(list(ideogram, cover_track,peak_track, tx,
GenomeAxisTrack()), chromosome="chr20",
from = start_pos, to=end_pos)
Fragment 2
tx <- AnnotationTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")
Fragment 3
tx <- GeneRegionTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")
Fragment 4
library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)
To ćwiczenie jest częścią kursu
ChIP-seq z Bioconductor w R
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Przekształć teorię w praktykę dzięki jednemu z naszych interaktywnych ćwiczeń
Rozpocznij ćwiczenie