Zacznij terazZacznij za darmo

Dodawanie adnotacji

Przyjrzyj się temu wykresowi:

Jest bardzo podobny do tego, który utworzyłeś w poprzednim ćwiczeniu. Oprócz danych widoczna jest na nim ścieżka o nazwie Genes z adnotacjami genów. W jakiej kolejności należy wykonać poniższe fragmenty kodu, aby dodać tę ścieżkę do wykresu?

Fragment 1

plotTracks(list(ideogram, cover_track,peak_track, tx, 
           GenomeAxisTrack()), chromosome="chr20", 
           from = start_pos, to=end_pos)

Fragment 2

tx <- AnnotationTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Fragment 3

tx <- GeneRegionTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Fragment 4

library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)

To ćwiczenie jest częścią kursu

ChIP-seq z Bioconductor w R

Zobacz kurs

Interaktywne ćwiczenie praktyczne

Przekształć teorię w praktykę dzięki jednemu z naszych interaktywnych ćwiczeń

Rozpocznij ćwiczenie