Створіть діаграму boxplot
Ознайомтеся з набором даних про лейкемію, візуалізувавши рівні експресії першого гена за допомогою boxplot для пацієнтів зі стабільною та прогресуючою лейкемією.
Ця вправа є частиною курсу
Аналіз диференційної експресії з limma в R
Інструкції до вправи
Матриця експресії (x), дані про ознаки (f) та фенотипові дані (p) вже завантажені у ваш робочий простір.
Зробіть вибірку
x, щоб залишити лише перший ген (тобто рядок), і підставте його ліворуч від~у формулі (вісь y).Зробіть вибірку
p, щоб залишити лише стовпець"Disease", і підставте його праворуч від~у формулі (вісь x).Зробіть вибірку
f, щоб залишити лише перший ген (тобто рядок) і стовпець"symbol". Використайте це як аргументmainдля заголовка графіка.
Інтерактивна практична вправа
Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)