1. Learn
    2. /
  2. Курси
    3. /
  3. Аналіз диференційної експресії з limma в R
Connected

Вправа

Графік «вулкан»

Тепер ви візуалізуєте ступінь диференційної експресії для кожного контрасту за допомогою графіка «вулкан», який показує логарифмічні шанси диференційної експресії на осі y та логарифм змінення фолду на осі x.

Інструкції

100 XP

Об'єкт підгонки моделі fit2 уже завантажено у ваш робочий простір. Пакет limma уже підключено.

  • Отримайте символи генів (symbol) із датафрейму fit2$genes.

  • Створіть графік «вулкан», який підсвічує топ-5 генів для кожного з 3 контрастів.