1. Learn
    2. /
  2. Курси
    3. /
  3. Аналіз диференційної експресії з limma в R
Connected

Вправа

Матриця контрастів

Щоб перевірити вплив доксорубіцину на серця мишей дикого типу та мишей із нокаутом Top2b (а також будь-яку взаємодію між лікуванням і генотипом), потрібно зіставити коефіцієнти з матриці дизайну.

Інструкції

100 XP

Об'єкт ExpressionSet eset із даними про доксорубіцин і матриця дизайну design вже завантажені у ваш робочий простір. Пакет limma вже підключено.

  • Створіть dox_wt, щоб перевірити ефект доксорубіцину у мишей дикого типу.

  • Створіть dox_top2b, щоб перевірити ефект доксорубіцину у мишей із нокаутом Top2b.

  • Створіть член взаємодії, щоб перевірити відмінності у відповіді на доксорубіцин між двома типами мишей (підказка: зіставте dox_top2b і dox_wt).