Связь пиков с генами

Вы почти готовы к детальному изучению взаимосвязи между пиками, генами и их функциями. Но сначала давайте внимательнее рассмотрим, как местоположение пиков соотносится с генами. Пакет chipenrich предоставляет удобные функции для визуализации. Объект peaks содержит координаты пиков, которые вы использовали ранее. Функция plot_dist_to_tss() строит график распределения расстояний между пиками и сайтами начала транскрипции (TSS) генов.

Функция plot_chipenrich_spline() позволяет оценить частоту встречаемости пиков в зависимости от длины генов. Помимо наблюдаемых частот, она также отображает ожидаемое распределение для точного критерия Фишера, биномиальной модели и модели, используемой функцией chipenrich().