Сравнение отфильтрованных данных с исходными ридами
Давайте подробнее рассмотрим, какую роль играет фильтрация ридов. На графике представлены три трека покрытия. Сверху вниз: суммарное покрытие, покрытие по высококачественным выравниваниям и покрытие по низкокачественным выравниваниям.
Изучите график выше. Какие из приведённых утверждений точно описывают показанные данные покрытия?
- Большинство выравниваний ридов были высококачественными.
- Наиболее выраженные пики обусловлены низкокачественными выравниваниями.
- В профиле высококачественного покрытия присутствуют пики.
Это упражнение является частью курса
ChIP-seq с Bioconductor в R
Практическое интерактивное упражнение
Превратите теорию в практику с помощью одного из наших интерактивных упражнений
Начать упражнение