НачатьНачать бесплатно

Добавление аннотаций

Посмотрите на этот график:

Он очень похож на тот, который вы создали в предыдущем упражнении. Помимо данных, на нём отображается дорожка Genes с аннотациями генов. В каком порядке следует выполнить приведённые ниже фрагменты кода, чтобы добавить эту дорожку на график?

Фрагмент 1

plotTracks(list(ideogram, cover_track,peak_track, tx, 
           GenomeAxisTrack()), chromosome="chr20", 
           from = start_pos, to=end_pos)

Фрагмент 2

tx <- AnnotationTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Фрагмент 3

tx <- GeneRegionTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Фрагмент 4

library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)

Это упражнение является частью курса

ChIP-seq с Bioconductor в R

Посмотреть курс

Практическое интерактивное упражнение

Превратите теорию в практику с помощью одного из наших интерактивных упражнений

Начать упражнение