Какие пики различаются?

Давайте посмотрим, насколько сильно образцы различаются по составу пиков. Используя объединённые пики, с которыми вы уже работали, определим, сколько пиков является общими для разных образцов.

Один из способов визуализировать это — диаграмма Венна. Её можно построить непосредственно из объекта DBA с помощью функции dba.plotVenn(). Альтернативный вариант — UpSet-график, который создаётся с помощью пакета UpSetR. Он заменяет эллипсы диаграммы Венна серией столбчатых диаграмм, отображающих размеры различных подмножеств. Функция upset() принимает на вход таблицу данных, в которой каждый столбец соответствует одному набору (то есть образцу) и указывает на принадлежность каждого пика к этому набору. Необходимые данные хранятся в поле called объекта ar_diff.