НачатьНачать бесплатно

Загрузка счётчиков ридов

Как вы видели в видео, перед тестированием дифференциального связывания необходимо сформировать набор консенсусных пиков. Это можно сделать с помощью следующей строки кода на R:

ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)

Рассмотрите приведённые ниже утверждения.

  1. В ar_counts для всех образцов будут рассчитаны счётчики ридов для одного и того же набора пиков.
  2. Некоторые счётчики ридов могут быть равны 0.
  3. Все пики в ar_counts имеют ширину 200 п.н.
  4. Все пики в ar_counts имеют ширину 400 п.н.

Какие из этих утверждений верны?

Это упражнение является частью курса

ChIP-seq с Bioconductor в R

Посмотреть курс

Практическое интерактивное упражнение

Превратите теорию в практику с помощью одного из наших интерактивных упражнений

Начать упражнение