ÎncepețiÎncepe gratuit

Adăugarea adnotărilor

Aruncă o privire la acest grafic:

Este foarte asemănător cu cel pe care l-ai creat în exercițiul anterior. Pe lângă date, afișează și un track numit Genes cu adnotări genice. În ce ordine ai executa următoarele fragmente de cod pentru a adăuga acest track în grafic?

Fragmentul 1

plotTracks(list(ideogram, cover_track,peak_track, tx, 
           GenomeAxisTrack()), chromosome="chr20", 
           from = start_pos, to=end_pos)

Fragmentul 2

tx <- AnnotationTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Fragmentul 3

tx <- GeneRegionTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Fragmentul 4

library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)

Acest exercițiu face parte din cursul

ChIP-seq cu Bioconductor în R

Vezi cursul

Exercițiu interactiv practic

Transformă teoria în practică cu unul dintre exercițiile noastre interactive

Începe exercițiul