Maak een boxplot

Verken de leukemiegegevensset door de expressieniveaus van het eerste gen te visualiseren met boxplots voor de patiënten met stabiele en progressieve leukemie.

Deze oefening maakt deel uit van de cursus

Differentiële-expressieanalyse met limma in R

Cursus bekijken

Oefeninstructies

De expressiematrix (x), featuredata (f) en fenotypedata (p) zijn geladen in je werkruimte.

Subselecteer x zodat alleen het eerste gen (d.w.z. de eerste rij) overblijft en zet dit links van de ~ in de formule (y-as).
Subselecteer p zodat alleen de kolom "Disease" overblijft en zet dit rechts van de ~ in de formule (x-as).
Subselecteer f zodat alleen het eerste gen (d.w.z. de eerste rij) en de kolom "symbol" overblijven. Gebruik dit als het argument voor main voor de plottitel.

Praktische interactieve oefening

Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)

Code bewerken en uitvoeren