or
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Om te beginnen herhaal je de doelen van differentiële-expressieanalyse, beheer je genexpressiedata met R en Bioconductor, en voer je je eerste differentiële-expressieanalyse uit met limma.
In dit hoofdstuk leer je hoe je lineaire modellen opstelt om te testen op differentiële expressie voor veelvoorkomende experimentele ontwerpen.
Nu je hebt geleerd hoe je differentiële-expressietesten uitvoert, leer je vervolgens hoe je de kenmerken (features) normaliseert en filtert, controleert op technische batch-effecten en de resultaten beoordeelt.
In dit laatste hoofdstuk gebruik je je nieuwe vaardigheden om een end-to-end differentiële-expressieanalyse uit te voeren van een studie met een factoriëel design, om de impact te bepalen van het kankermedicijn doxorubicine op de harten van muizen met verschillende genetische achtergronden.
Huidige oefening