Boxplot Top2b
Berikutnya, lakukan pemeriksaan kewarasan: buat boxplot tingkat ekspresi Top2b untuk memastikan mencit null memiliki tingkat ekspresi Top2b yang lebih rendah.
Ingat bahwa Anda membuat boxplot serupa di Bab 1 Latihan 4.
Latihan ini adalah bagian dari kursus
Analisis Ekspresi Diferensial dengan limma di R
Petunjuk latihan
Objek ExpressionSet eset dengan data doxorubicin telah dimuat di ruang kerja Anda.
Temukan baris yang berisi data Top2b dengan mencari kolom data fitur
"symbol"untuk"Top2b".Buat boxplot menggunakan sintaks rumus. Tingkat ekspresi harus di sebelah kiri
~, dan variabel genotipe di sebelah kanan.Operkan baris data frame fitur ke
mainuntuk memberi judul pada plot.
Latihan interaktif praktis
Cobalah latihan ini dengan menyelesaikan kode contoh berikut.
# Find the row which contains Top2b expression data
top2b <- which(___(eset)[___] == "Top2b")
# Plot Top2b expression versus genotype
boxplot(___(eset)[top2b, ] ~ ___(eset)[___],
main = ___(eset)[top2b, ])