Explorer le génome de la levure
Vous allez commencer à explorer vous-même le génome de la levure à l'aide du paquet BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, déjà installé pour vous.
Comme pour d'autres données dans R, vous pouvez utiliser head() et tail() pour examiner l'objet yeastGenome. Vous pouvez aussi extraire un sous-ensemble du génome par chromosome en utilisant la syntaxe $ comme suit : object_name$chromosome_name.
Les noms des chromosomes peuvent être obtenus avec la fonction names(), et nchar() peut servir à compter le nombre de caractères d'une séquence.
Cette activité fait partie du cours
Introduction à Bioconductor en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___