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Pourquoi fastq?

Jusqu'ici, vous avez découvert le paquet ShortRead et ses outils utiles pour les premières étapes de l'analyse de séquences à courtes lectures. En résumé, ses principales fonctionnalités sont :

  • Importation des données
  • Évaluation de la qualité
  • Transformation des données
  • Accès aux analyses en aval

Dans ce contexte, vous avez vu deux types de fichiers : fasta et fastq.

Selon vous, pourquoi utilise-t-on des fichiers au format fastq?

Cette activité fait partie du cours

Introduction à Bioconductor en R

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Exercice interactif pratique

Passez de la théorie à l’action grâce à l’un de nos exercices interactifs

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