BiocManager pour installer des packages
BSgenome est un package de données Bioconductor qui contient des représentations de plusieurs génomes. Ce package a déjà été installé pour vous, car l'installation des dépendances prend généralement un certain temps, au moyen du code suivant:
# Install BSgenome
BiocManager::install("BSgenome")
Cette activité fait partie du cours
Introduction à Bioconductor en R
Instructions de l’exercice
- Utilisez
library()pour charger le packageBSgenome. Notez queBSgenomea déjà été installé pour vous. - Lisez les messages affichés et voyez les packages requis.
- Vérifiez les versions de tous les packages chargés dans la session.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Load the BSgenome package
___
# Check the versions of the packages loaded in the session
___