1. Apprendre
  2. /
  3. Cours
  4. /
  5. Introduction à Bioconductor en R

Connected

Exercice

Explorer la séquence du virus Zika

À vous d'explorer le génome du virus Zika, déjà chargé dans votre espace de travail sous le nom zikaVirus. Le génome provient du NCBI et vous pouvez utiliser les fonctions de Biostrings pour en apprendre davantage.

Commencez par vérifier l'alphabet de la séquence.

alphabet() # Affiche les lettres incluses dans la séquence
alphabetFrequency() # Affiche le nombre d'occurrences par lettre

Rappelez-vous de la vidéo : chaque alphabet correspond à un conteneur biostring précis, et chaque alphabet comporte généralement des lettres et des symboles supplémentaires.

Instructions 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Utilisez alphabet() pour savoir quelles lettres sont incluses dans zikaVirus.