Interagir avec IRanges
Vous pouvez utiliser la fonction IRanges() pour créer une seule séquence. Vous pouvez aussi fournir des vecteurs à IRanges() pour créer plusieurs intervalles de séquences en même temps. C'est à la fois fascinant et pratique! La création des objets seq_1 et seq_2 en est un exemple.
Pour cet exercice, vérifiez la largeur de chacune des séquences fournies ici, à l'aide de width() et de lengths(). Observez la différence entre les deux types de résultats.
Rappelez-vous que width = end - start + 1.
Cette activité fait partie du cours
Introduction à Bioconductor en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Create the first sequence seq_1
seq_1 <- IRanges(start = 10, end = 37)
# Create the second sequence seq_2
seq_2 <- IRanges(start = c(5, 35, 50),
end = c(12, 39, 61),
names = LETTERS[1:3])
# Check the width of seq_1 and seq_2
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