Manipuler des Biostrings
À partir d'une courte séquence (dna_seq) tirée de l'objet zikaVirus, c'est à votre tour d'expérimenter les deux processus biologiques : transcription et traduction.
Dans les deux premières parties de cet exercice, vous appliquerez ces processus séparément. Dans la dernière, vous les effectuerez en une seule étape.
Vous utiliserez ici une toute petite séquence, mais rappelez-vous que la vraie force de Biostrings se révèle lorsqu'on manipule des séquences beaucoup plus longues.
Le paquet Biostrings a déjà été chargé pour vous. Avec zikaVirus, vous allez traduire les 21 premiers caractères en un AAString.
Cette activité fait partie du cours
Introduction à Bioconductor en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq