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Exercice

Manipuler des Biostrings

À partir d'une courte séquence (dna_seq) tirée de l'objet zikaVirus, c'est à votre tour d'expérimenter les deux processus biologiques : transcription et traduction.

Dans les deux premières parties de cet exercice, vous appliquerez ces processus séparément. Dans la dernière, vous les effectuerez en une seule étape.

Vous utiliserez ici une toute petite séquence, mais rappelez-vous que la vraie force de Biostrings se révèle lorsqu'on manipule des séquences beaucoup plus longues.

Le paquet Biostrings a déjà été chargé pour vous. Avec zikaVirus, vous allez traduire les 21 premiers caractères en un AAString.

Instructions 1/3

undefined XP
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  • Appliquez unlist() à l'ensemble zikaVirus et sélectionnez les 21 premières paires de bases avec subseq(). L'objet obtenu sera un objet "DNAString".
  • Transcrivez dna_seq en un "RNAString" et assignez-le à rna_seq.