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Graphique de qualité par base

Cette figure a été créée pour vous à partir des encodages de qualité par base d'un fichier fastq complet. Ce fichier utilise l'encodage Illumina. L'encodage maximal est I, soit un score de 40. Les encodages de bonne qualité ont des scores de 33 ou plus, en d'autres mots, B ou plus. baseQuality.png

Vous pouvez consulter les détails d'encodage pour Illumina ici.

  • Quels scores sont les plus représentés dans la figure?

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Introduction à Bioconductor en R

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Exercice interactif pratique

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