Interaction avec les classes
Supposons que nous ayons un objet nommé a_genome de classe BSgenome. Avec a_genome, vous pouvez poser des questions comme celles-ci :
# Quelle est la classe principale de a_genome ?
class(a_genome) # "BSgenome"
# Quelles sont les autres classes de a_genome ?
is(a_genome) # "BSgenome", "Annotated"
# a_genome est-il une représentation S4 ?
isS4(a_genome) # TRUE
Si vous souhaitez en savoir plus sur l'objet a_genome, vous pouvez utiliser l'accesseur show(a_genome) ou d'autres accesseurs spécialisés tirés de la liste de .S4methods(class = "BSgenome").
Cette activité fait partie du cours
Introduction à Bioconductor en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Investigate the a_genome using show()
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