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Interaction avec les classes

Supposons que nous ayons un objet nommé a_genome de classe BSgenome. Avec a_genome, vous pouvez poser des questions comme celles-ci :

# Quelle est la classe principale de a_genome ?
class(a_genome)  # "BSgenome"

# Quelles sont les autres classes de a_genome ?
is(a_genome)  # "BSgenome", "Annotated"

# a_genome est-il une représentation S4 ?
isS4(a_genome)  # TRUE

Si vous souhaitez en savoir plus sur l'objet a_genome, vous pouvez utiliser l'accesseur show(a_genome) ou d'autres accesseurs spécialisés tirés de la liste de .S4methods(class = "BSgenome").

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Introduction à Bioconductor en R

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Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.

# Investigate the a_genome using show()
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Modifier et exécuter le code