拟合模型
现在，您已准备好进行差异结合分析。该分析将告诉您在两种肿瘤类型之间，哪些峰的强度存在显著差异。找出组间差异峰，将为后续分析奠定基础，这些分析旨在揭示驱动这些差异的潜在机制。当前，我们先来查找差异结合的峰。DiffBind 包中的 dba.analyze() 函数可以完成这项工作。在上一个练习中，您已经为不同肿瘤类型之间的比较设定了对比。基于包含该对比的对象，您只需调用 dba.analyze() 就能完成其余步骤。
本练习是课程的一部分
在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析
练习说明
- 检查
ar_binding对象，确认其中包含所需的对比。 - 运行差异结合分析。
- 查看结果。
交互式实操练习
通过完成这段示例代码来试试这个练习。
# Examine the `ar_binding` object to confirm that it contains the required contrast
print(___)
# Run the differential binding analysis
ar_diff <- ___(ar_binding)
# Examine the result
print(___)