概述蛋白质结合差异
本课中您将看到的最后一个差异性结合峰图是箱线图。此类图可以用来概括每个样本中峰强度的分布。为此，DiffBind 提供了函数 dba.plotBox()。箱线图能够突出不同组的中位数位置，以及其周围数据的离散程度。DiffBind 生成的图会比较两组（原发肿瘤与耐药肿瘤），以及由差异性结合峰构成的子集。除了绘图本身，dba.plotBox() 还会返回这些组之间成对比较的 p 值。
与之前相同，差异结合分析的结果已保存在 ar_diff 中。
本练习是课程的一部分
在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析
练习说明
- 创建峰强度的箱线图。
- 查看返回的 p 值。哪些峰集合之间存在显著差异？
交互式实操练习
通过完成这段示例代码来试试这个练习。
# Create a box plot of the peak intensities
compare_groups <- ___(ar_diff, notch=FALSE)
# Inspect the returned p-values
print(___)