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火山图

火山图用于可视化组间差异(以对数倍数变化表示)与用于比较峰强度的检验 p 值之间的关系。这样可以直观地查看具有统计显著性的结果及其效应量。DiffBind 提供了 dba.plotVolcano() 函数来生成这些图。

ar_diff 对象包含差异结合分析的结果。

本练习是课程的一部分

在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析

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练习说明

  • 创建一幅火山图。
  • 查看图形。显著结果位于何处?

交互式实操练习

通过完成这段示例代码来试试这个练习。

# Create a volcano plot
___(ar_diff)
编辑并运行代码