读取 BED 文件
在本练习中，您将从一个 BED 文件加载峰调用（peak calls），并利用这些峰位置信息，从一个 BAM 文件中提取与这些峰重叠的 reads。
本练习是课程的一部分
在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析
练习说明
- 使用
import.bed函数从 chr20_peaks 加载峰调用。 - 使用这些峰调用为 chr20_bam 创建一个
BamViews对象。 - 加载与峰调用重叠的 reads。
交互式实操练习
通过完成这段示例代码来试试这个练习。
# Load peak calls from chr20_peaks
peaks <- ___(chr20_peaks)
# Create a BamViews object
bam_views <- ___(___, bamRanges=peaks)
# Load the reads
reads <- ___(___)