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加载读段计数

正如您在视频中看到的,在进行差异结合检验之前,您需要先创建一组共识峰调用。可以使用以下 R 代码实现:

ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)

请判断下列说法:

  1. ar_counts 中,所有样本都会针对同一组峰调用得到读段计数。
  2. 有些读段计数可能为 0。
  3. ar_counts 中的所有峰宽度为 200 bp。
  4. ar_counts 中的所有峰宽度为 400 bp。

以上哪些说法是正确的?

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在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析

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