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这些样本在您看来相同吗?

检查 PCA 图可以让您从全局层面了解样本之间的相似性和差异。利用样本 QC 过程中生成的输出,可以直接对处理后的数据绘制 PCA 图。下面是通过 QC 的 4 个样本的图。

请查看该图,然后思考以下陈述。哪些是正确的?

  1. 样本按条件聚类。
  2. 这样的图可以用 plotPrincomp() 函数创建。
  3. 通过 PCA 图可以轻松看出哪些峰在组间差异最大。

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在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析

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