Создание диаграммы «ящик с усами»

Изучите набор данных по лейкемии: визуализируйте уровни экспрессии первого гена с помощью диаграмм «ящик с усами» для пациентов со стабильной и прогрессирующей формой лейкемии.

Это упражнение является частью курса

Анализ дифференциальной экспрессии с помощью limma в R

Посмотреть курс

Инструкции к упражнению

Матрица экспрессии (x), данные о признаках (f) и фенотипические данные (p) уже загружены в вашем рабочем пространстве.

Выберите из x только первый ген (то есть первую строку) и вставьте его левее ~ в формуле (ось Y).
Выберите из p только столбец "Disease" и вставьте его правее ~ в формуле (ось X).
Выберите из f только первый ген (то есть первую строку) и столбец "symbol". Используйте это значение в качестве аргумента main для заголовка графика.

Интерактивное практическое упражнение

Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)

Редактировать и запускать код