Crie um boxplot
Explore o conjunto de dados de leucemia visualizando, com boxplots, os níveis de expressão do primeiro gene para pacientes com leucemia estável e progressiva.
Este exercício faz parte do curso
Análise de Expressão Diferencial com limma em R
Instruções do exercício
A matriz de expressão (x), os dados de features (f) e os dados de fenótipo (p) já estão carregados no seu ambiente.
Faça subset de
xpara incluir apenas o primeiro gene (ou seja, a primeira linha) e insira-o à esquerda de~na fórmula (eixo y).Faça subset de
ppara incluir apenas a coluna"Disease"e insira-a à direita de~na fórmula (eixo x).Faça subset de
fpara incluir apenas o primeiro gene (ou seja, a primeira linha) e a coluna"symbol". Use isso como argumento demainpara o título do gráfico.
Exercício interativo prático
Experimente este exercício completando este código de exemplo.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)