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exercise

경로에 미치는 영향 이해하기

경로(pathway)는 유전자를 묶어 보는 또 다른 유용한 방법이에요. 이 연습 문제에서는 원발성 종양 샘플에서 더 두드러진 피크를 대상으로 한 경로 풍부화 분석 결과를 살펴봅니다. enrich_primary 객체에 결과가 들어 있어요. 이 객체는 네 개의 항목을 가진 리스트이며, 지금 단계에서 가장 중요한 것은 유의성 순으로 정렬된 풍부화 결과 데이터 프레임인 results입니다. 여기에는 유전자 집합의 ID와 이름, 그리고 해당 유전자 집합의 일부인 피크와 연관된 유전자들이 포함돼요. 여기서 유전자는 Entrez ID로 보고됩니다. org.Hs.eg.db 패키지가 제공하는 데이터베이스를 사용하면 Entrez ID와 유전자 기호 사이를 변환할 수 있어요. select() 함수는 ENTREZID 키 유형을 사용해 SYMBOL 열에서 항목을 선택할 수 있는 편리한 인터페이스를 제공합니다.

Instruktioner

100 XP
  • 최상위 유전자 집합을 살펴보세요.
  • 최상위 집합의 유전자 ID를 추출하세요.
  • 유전자 ID를 벡터로 분할하세요.
  • 유전자 ID를 유전자 기호로 변환하세요.