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여러분 눈에는 이 샘플들이 같아 보이나요?

PCA 플롯을 살펴보면 샘플 사이의 유사점과 차이를 전반적인 관점에서 파악할 수 있어요. 샘플 QC에서 생성된 출력을 사용하면 전처리된 데이터의 PCA 플롯을 쉽게 만들 수 있어요. 아래는 QC를 통과한 네 개 샘플 모두에 대한 플롯이에요.

플롯을 살펴본 뒤 다음 문장을 고려해 보세요. 어떤 문장이 사실인가요?

  1. 샘플은 조건별로 클러스터링돼요.
  2. 이런 플롯은 plotPrincomp() 함수로 생성할 수 있어요.
  3. PCA 플롯을 사용하면 집단 간에서 어떤 피크가 가장 많이 다른지 쉽게 알 수 있어요.

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R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

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